أصل هذا الكتاب رسالة دكتوراه قُدّمت إلى كلية أصول الدين -بجامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية بالرياض ونوقشت بتاريخ ١٤٠٦/٨/١٥هـ، الموافق ٢٤ / ٤ / ١٩٨٦م، ومنحت درجة الدكتوراه مع مرتبة الشرف الأولى في السُّنَّةِ وعلومها.
لقد حاز كتاب «المؤتلف والمختلف للإمام أبي الحسن علي بن عمر البغدادي الدارقطني الصدارة في بابه من يوم تصنيفه، وأصبح مرجع المشتغلين والدارسين في علوم الحديث والرجال. وقد وفق الله الأستاذ العلامة الدكتور موفق العبيدي لخدمته وتحقيقه، فأخرجه بصورة نالت رضا وثناء أهل الشأن، وصدرت عن دار الغرب الإسلامي طبعته الأولى التي انتشرت في الآفاق والبلدان. وبعد نفاد نسخ الكتاب من المكتبات وجد فضيلة المحقق ضرورة إعادة طباعته حرصًا على انتشاره مرة أخرى بين طلبة العلم، فأسند إعادة طبع الكتاب والعناية به إلى دار الأصول العلمية، وحيث كان ذلك فقد حرصوا على العناية به، وإعادة تنسيقه وترقيم فهارسه، وإخراجه بحلة قشيبة تليق بمكانة هذا الكتاب العظيم.
المؤتلف والمختلف هو كتاب ألفه الدارقطني في الأسماء والكنى والأنساب، ويعتبر من أهم وأول المصنفات في هذا العلم، ومعظم مادته في أسماء الأشخاص التي يقع الاشتباه بأسمائهم أو كناهم أو القابهم. كذلك ما يأتلف وما يختلف في أسماء القبائل وانسابها ومن ينتسب إليها نقلا عن أئمة النسابين. وقد رتب الكتاب على أساس الحروف في المعجم.